Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp10P52479 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp10P52479 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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