Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Opn1swP51491 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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