Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtshP49935 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtshP49935 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtshP49935 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtshP49935 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtshP49935 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtshP49935 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtshP49935 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtshP49935 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtshP49935 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtshP49935 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtshP49935 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms