Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LmnaP48678 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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