Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abcd1P48410 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcd1P48410 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms