Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SrprbP47758 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrprbP47758 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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