Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf9P41274 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf9P41274 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms