Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh15P33146 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh15P33146 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms