Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd2P30280 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms