Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VtnP29788 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VtnP29788 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VtnP29788 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VtnP29788 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms