Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RxraP28700 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RxraP28700 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RxraP28700 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RxraP28700 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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