Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NapbP28663 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NapbP28663 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NapbP28663 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NapbP28663 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NapbP28663 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NapbP28663 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NapbP28663 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NapbP28663 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NapbP28663 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NapbP28663 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NapbP28663 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NapbP28663 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NapbP28663 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms