Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hoxd10P28359 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd10P28359 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd10P28359 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd10P28359 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Hoxd10P28359 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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