Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjc1P28229 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms