Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xrcc5P27641 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Xrcc5P27641 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Xrcc5P27641 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Xrcc5P27641 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Xrcc5P27641 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Xrcc5P27641 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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