Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ggta1P23336 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms