Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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