Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RarbP22605 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RarbP22605 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RarbP22605 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RarbP22605 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RarbP22605 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RarbP22605 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RarbP22605 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RarbP22605 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms