Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Fcer1aP20489 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Fcer1aP20489 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Fcer1aP20489 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Fcer1aP20489 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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