Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TP20293 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TP20293 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TP20293 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TP20293 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TP20293 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TP20293 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TP20293 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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