Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms