Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sdc1P18828 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms