Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Calb1P12658 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms