Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
OtcP11725 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OtcP11725 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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