Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp1P11103 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms