Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd4P10628 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms