Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P10404 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P10404 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
P10404 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms