Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb7P09024 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms