Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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