Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P04214 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P04214 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P04214 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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