Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BlmO88700 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BlmO88700 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BlmO88700 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BlmO88700 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BlmO88700 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BlmO88700 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BlmO88700 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BlmO88700 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BlmO88700 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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