Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms