Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek2O35942 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms