Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sp100O35892 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Sp100O35892 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sp100O35892 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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