Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Opn1mwO35599 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Opn1mwO35599 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Opn1mwO35599 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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