Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh2d1bO35324 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms