Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms