Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casq1O09165 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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