Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eftud2O08810 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms