Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Barx2O08686 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Barx2O08686 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Barx2O08686 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms