Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc180J3QNE4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms