Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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