Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3336J3QMQ6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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