Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm20828J3KMI7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm20828J3KMI7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms