Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp17ldG5E8G2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp17ldG5E8G2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms