Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9yF8VPU6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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