Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M1F7CXU4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms