Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3371F7CQW8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3371F7CQW8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3371F7CQW8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3371F7CQW8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3371F7CQW8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3371F7CQW8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3371F7CQW8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3371F7CQW8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms