Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm28038F7BCN9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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