Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 1700019C18Rik-203ENSMUST00000222085 1766 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm20538F6Z9R1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms